Odpočet DPH

Dobrý den, potřebuji poradit při vedení Daňové evidence. Máme účetní program a nevím jak přesně zaúčtovat FA přijaté. Každý dodavatel počítá DPH jinak (někdo použvá příklad: děleno 1,21 a někdo koeficient, někdo zaokrouhluje částku před výpočtem DPH, někdo až potom). Účetní program, když mu zadám celkovou částku k úhradě, mi sám spočte základ i DPH, ale to pak nesouhlasí se základem a DPH na faktuře-většinou se jedná o haléře. Jakou částku mám tedy správně zadat a jak zaúčtovávat při zaokrouhlování? Děkuji za odpověď, teprve začínám účtovat pro manžela........ S pozdravem Jana