1. musíte si právně vyjasnit, jak to že s.r.o. smí zbourat budouvu, kterou nevlastní.
2. musíte si právně vyjasnit, jak to bude se stavbou na cizím pozemku (od 1.1. 2014 už to nebude tak jednoduché)

Účetní a daňové důsledky možných řešení:

1. Pokud jako FO budete vlastníkem nové budovy, bude zůstatková cena staré budovy součástí pořizovací ceny nové
2. Pokud prodáte starou budovu (popř. i s pozemkem) s.r.o., bude zůstatková cena budovy daňově uznatelným nákladem. Pokud se s.r.o. stane vlastníkem nové budovy, bude pro ní platit obdobně bod 1. Pozor na to, že jste spřízněné osoby a případný prodej za cenu odchylující se od tržní ceny může být daňově nevýhodné
3. Pokud zbouráte budovu za účelem prodeje prázdného pozemku s.r.o., pak můžete zůstatkovou cenu uplatnit jako daňový náklad.

Myslím, že existuje ještě celá řada dalších variant, jak může právně situace vypadat. Až v tom budete mít jasno, je možné domyslet i jejich účetní a daňové důsledky.